动眼神经麻痹通常由多种原因引起。大约有30% - 50%的动眼神经麻痹是由于颅内动脉瘤压迫导致的，另外，糖尿病性动眼神经麻痹也较为常见，约占动眼神经麻痹病例的15% - 20%。
颅内病变导致
动脉瘤压迫： 颅内的动脉瘤，尤其是后交通动脉瘤，容易压迫动眼神经。动脉瘤是血管壁的异常膨出，当它增大到一定程度时，就会对周围的动眼神经产生压迫，从而引起动眼神经麻痹。例如，后交通动脉瘤常见的表现就是单侧动眼神经麻痹，患者可能出现眼睑下垂、眼球运动障碍等症状。脑血管病变： 脑梗死、脑出血等脑血管病变也可能引发动眼神经麻痹。脑梗死是由于脑血管堵塞，导致局部脑组织缺血缺氧坏死；脑出血则是脑血管破裂出血，压迫周围神经组织。当病变影响到动眼神经所经过的区域时，就会出现动眼神经麻痹的表现。比如，脑干梗死可能累及动眼神经核或其纤维，导致相应的眼球运动和眼睑功能异常。
外伤因素所致
头颅外伤： 头部受到外力撞击等外伤时，可能会损伤动眼神经。比如车祸导致的头部外伤，或者高处坠落头部着地等情况，都可能使动眼神经受到牵拉、撕裂等损伤，进而引起动眼神经麻痹。患者可能在受伤后很快出现眼睑下垂、眼球不能正常转动等症状。眼部外伤： 眼部的严重外伤，如眼眶骨折等，也可能波及动眼神经，导致动眼神经麻痹。眼眶骨折时，骨折碎片可能压迫动眼神经，或者骨折引起的局部组织水肿等情况影响动眼神经的正常功能，从而出现相应的眼部运动和眼睑异常表现。
感染性因素引发
脑膜炎： 细菌、病毒等感染引起的脑膜炎，炎症蔓延可能累及动眼神经。例如，结核性脑膜炎、化脓性脑膜炎等，炎症刺激会影响动眼神经的正常传导，导致动眼神经麻痹。患者可能同时伴有发热、头痛、颈项强直等脑膜炎的相关症状。海绵窦综合征： 海绵窦内发生感染等病变时，也会影响动眼神经。海绵窦内有动眼神经等多种颅神经通过，当海绵窦发生炎症、血栓等病变时，就会压迫动眼神经，出现动眼神经麻痹的症状，同时还可能伴有眼球突出、面部感觉异常等表现。
肿瘤相关原因
颅内肿瘤： 颅内的肿瘤，如垂体瘤、颅底肿瘤等，可能压迫动眼神经。肿瘤不断生长增大，会对周围的神经组织包括动眼神经产生压迫，从而引起动眼神经麻痹。例如，垂体瘤向鞍上发展时，可能压迫动眼神经，导致患者出现眼睑下垂、眼球运动受限等症状。眼眶肿瘤： 眼眶内的肿瘤，如神经鞘瘤等，也可能压迫动眼神经，引起动眼神经麻痹。眼眶肿瘤增大后，会占据空间，压迫动眼神经，导致眼部运动和眼睑功能异常。