手足口病是由肠道病毒引起的传染病，目前并没有特效的抗病毒药物。一般来说，对症治疗为主，比如体温超过38.5℃时可使用对乙酰氨基酚等退烧药来降温。
对症治疗药物情况
退热药物： 当患儿体温达到38.5℃及以上时，可选用对乙酰氨基酚，它适用于3个月以上的儿童；对于6个月以上的儿童，还可以考虑使用布洛芬。但要注意按照体重和说明书推荐的剂量使用，不能过量。缓解口腔疼痛药物： 如果患儿口腔有疱疹导致疼痛影响进食，可使用康复新液等促进口腔黏膜修复，缓解疼痛。也可以使用含有利多卡因的凝胶来暂时缓解疼痛，但要在医生指导下使用，因为低龄儿童使用需要特别谨慎。
抗病毒药物使用情况
一般不推荐常规使用抗病毒药物： 目前临床上对于手足口病患儿，不常规推荐使用抗病毒药物。因为大多数手足口病是自限性疾病，病程一般在1 - 2周左右。只有少数重症患儿可能需要使用抗病毒药物，比如肠道病毒71型感染的重症患儿，在发病早期（通常是发病后3 - 5天内）可考虑使用静脉用丙种球蛋白等，但这需要严格掌握适应证，由医生根据患儿具体病情来决定。
特殊人群用药注意
儿童用药需谨慎： 对于婴幼儿，使用药物时要格外小心剂量和剂型。比如退烧药的选择和用量都要严格按照儿童体重计算。而且要密切观察用药后的反应，如是否有皮疹、呕吐等过敏或不良反应。如果患儿同时有其他基础疾病，用药更要谨慎，需在医生全面评估后使用。孕妇及哺乳期女性： 如果哺乳期女性感染手足口病，在照顾患儿时要做好防护，如戴口罩等。用药方面需要咨询医生，因为某些药物可能会通过乳汁影响婴儿，所以必须在医生指导下选择对婴儿影响较小的药物来治疗自身的手足口病。