乙肝大三阳难以根治，仅极少数可根治转阴。其难以根治原因主要有：一、病毒变异变化大；二、患者病毒复制活跃，传染性强；三、部分患者产生耐药性，且治疗周期长，患者难以坚持规范用药疗程，常需数年甚至更长时间用药，却常因工作、家务等耽搁用药，或自认为无症状或已治愈便不用药，导致病毒再次复制，反复停药用药致病毒耐药或用药不规范而难以治愈。不过若是初发病例或儿童初次发病患者，少数可治愈或根治，这主要是因为儿童处于生长发育阶段，机体免疫系统进一步完善，免疫增强，若一开始就规范坚持连续用药数年，一直规范使用抗病毒药物，多数能完全恢复且不复发，甚至产生免疫性抗体（乙肝表面抗体），以后便不易感染乙肝病毒。
总结概况提示：乙肝大三阳根治困难，原因多样，但初发病例或儿童患者有根治可能，需规范持续用药。