怀孕40天不想要孩子，可以通过药流或人工流产终止妊娠。药流适合怀孕49天内的女性，人工流产则适合怀孕10周内的女性。但药流可能会出现药流不全，需要再次清宫；人工流产则可能会引起子宫穿孔、出血、感染等并发症。因此，建议你先到医院进行检查，根据医生的建议选择合适的终止妊娠方式。
此外，无论选择哪种方式，都需要在正规医院进行，并遵循医生的指导和建议。同时，术后要注意休息和保养，避免感染和并发症的发生。
需要注意的是，流产对女性的身体和心理都会造成一定的影响。如果你还没有做好要孩子的准备，建议在性生活中采取有效的避孕措施，避免意外怀孕。