乙肝大三阳和小三阳主要在E抗原和E抗体、传染性、病毒复制量等方面存在区别。乙肝是因人体感染乙型肝炎病毒而导致肝损伤等后果的疾病，通过乙肝五项检查会出现大三阳和小三阳两种情况，二者有明显差异。一、E抗原和E抗体：大三阳的乙肝5项检查中E抗原为阳性，而小三阳则是E抗体为阳性，且两者的表面抗原和核心抗体都为阳性。二、传染性：大三阳的传染性较强，因为其乙型肝炎病毒较为活跃；小三阳的传染性相对较弱，但两者都有传染的可能。三、病毒复制量：由于大三阳患者缺乏相应抗体抑制，其乙型肝炎病毒处于活跃复制状态，血液中的乙型肝炎病毒量比小三阳患者高很多，对肝脏的破坏也更大。
总之，乙肝大三阳和小三阳在多个方面存在不同，了解这些区别对于疾病的诊断、治疗和预防都具有重要意义。