儿童抽动症的病因目前尚未完全明确，一般认为可能与遗传因素、神经生化因素以及心理社会因素等有关。据研究显示，约50% - 60%的抽动症儿童有家族遗传史，若家族中有成员患抽动症，儿童患病风险会增加。
一、遗传因素方面
基因遗传倾向： 抽动症具有一定的遗传易感性，相关基因的突变或多态性可能会增加患病风险。比如某些与神经递质调控相关的基因发生异常变化时，就可能影响神经系统的正常功能，从而引发抽动症状。家族聚集现象： 如果家族中父母一方或双方患有抽动症，其子女患病的概率比普通人群明显要高。有统计数据表明，家族中有抽动症患者的家庭，儿童患病几率大约是无家族史家庭的2 - 3倍。
二、神经生化因素方面
神经递质失衡： 多巴胺、去甲肾上腺素、5 - 羟色胺等神经递质的失衡可能与抽动症有关。例如多巴胺功能亢进时，可能会导致抽动症的发生。研究发现，多巴胺受体相关基因的异常可能会影响多巴胺的传递，进而干扰神经系统对肌肉运动的调控，引发抽动表现。乙酰胆碱系统异常： 乙酰胆碱在神经系统中也起着重要作用，当乙酰胆碱系统出现异常时，也可能参与抽动症的发病过程。比如乙酰胆碱的代谢或受体功能发生改变，会影响神经信号的传递，导致肌肉不自主地抽动。
三、心理社会因素方面
精神压力过大： 长期处于精神紧张、焦虑、压力大的环境中，比如儿童在学校面临过大的学习压力、与同学关系紧张，或者家庭环境不和谐等情况，都可能诱发或加重抽动症。有调查发现，约30% - 40%的抽动症儿童在发病前有明显的精神刺激因素，像父母离异、亲人离世、受到严厉批评等。不良生活事件影响： 一些突发的不良生活事件，如经历重大的惊吓、突然更换生活环境等，也可能成为抽动症的诱因。例如儿童突然转学，不适应新环境，心理上受到冲击后，就有可能出现抽动症状。