毛囊炎主要是由细菌等病原体感染引起的，比如金黄色葡萄球菌就常是引发毛囊炎的常见病菌，约60% - 70%的毛囊炎是由金黄色葡萄球菌导致的。
皮肤卫生状况不佳导致
皮肤清洁不到位： 如果长时间不洗澡，皮肤表面会积累大量污垢、油脂等，容易堵塞毛囊口，为细菌滋生创造条件，从而引发毛囊炎。例如，长时间处于户外劳作且不及时清洁的人，就较易出现毛囊炎。毛发过度牵拉： 比如经常扎很紧的头发，会使毛囊受到过度牵拉，损伤毛囊周围组织，增加感染毛囊炎的风险。像长期扎高马尾的女性，发际线部位就可能更容易长毛囊炎。
机体免疫力低下引发
患有基础疾病： 像糖尿病患者，由于血糖控制不佳，机体抵抗力下降，白细胞的杀菌作用受到影响，更容易受到细菌侵袭引发毛囊炎。研究发现，糖尿病患者发生毛囊炎的概率比正常人高约3 - 5倍。长期使用免疫抑制剂： 一些患有自身免疫性疾病需要长期使用糖皮质激素等免疫抑制剂的患者，免疫力降低，容易让细菌等病原体趁虚而入引发毛囊炎。
毛囊本身受损所致
皮肤外伤： 皮肤受到擦伤、抓伤等外伤后，皮肤的屏障功能受损，细菌容易侵入毛囊引发炎症。比如运动时皮肤擦伤后若不及时处理，就可能发展为毛囊炎。接触刺激性物质： 长期接触焦油类、油脂类等刺激性物质，会损伤毛囊，使毛囊容易被细菌感染引发毛囊炎。例如从事与焦油相关工作的人群，就需特别注意防护毛囊。