全血细胞减少可能由多种原因引起。比如血液系统疾病，像再生障碍性贫血，约有一半以上的再生障碍性贫血患者会出现全血细胞减少的情况，它是由于骨髓造血功能衰竭导致的；还有骨髓增生异常综合征，患者骨髓中的造血细胞会出现发育异常，进而影响血细胞生成，引发全血细胞减少。
血液系统疾病相关原因
再生障碍性贫血： 是骨髓造血干细胞和造血微环境损伤所致的骨髓造血功能衰竭症。患者除了全血细胞减少外，还会有贫血、出血、感染等表现，其发病可能与遗传因素、化学物质（如苯及其衍生物）、病毒感染等有关。骨髓增生异常综合征： 是一组起源于造血干细胞的异质性髓系克隆性疾病。骨髓中造血细胞呈现病态造血，外周血中血细胞减少，患者可能出现乏力、贫血、感染、出血等症状，发病机制与基因突变等因素相关。
非血液系统疾病相关原因
严重感染： 某些严重的细菌、病毒感染可能影响骨髓造血功能，导致全血细胞减少。例如伤寒杆菌感染，严重时可抑制骨髓造血，使红细胞、白细胞、血小板等生成减少。脾功能亢进： 各种原因引起的脾大，会导致脾功能亢进，破坏过多的血细胞。比如肝硬化患者常伴有脾大，进而出现全血细胞减少的情况，因为脾脏会过度吞噬和破坏红细胞、白细胞和血小板。
药物及化学物质影响
药物因素： 一些药物可能引起全血细胞减少，如氯霉素，它可能抑制骨髓造血干细胞的功能，导致血细胞生成减少。还有抗肿瘤药物，在抑制肿瘤细胞的同时，也可能对正常造血干细胞产生毒性作用，引起全血细胞减少。化学物质接触： 长期接触苯、砷等化学物质，会损伤骨髓造血干细胞，影响血细胞的正常生成，从而导致全血细胞减少。比如长期在含有苯的环境中工作的人群，患全血细胞减少相关疾病的风险会增加。