肾囊肿是否会引发腰疼取决于其具体状况：
一、小的肾囊肿：较小的轻度肾囊肿一般不会引起腰疼。因为这类肾囊肿通常不会给患者带来显著的不适表现，所以也就不会出现腰部疼痛情况。
二、比较大的囊肿：当肾囊肿较大，其直径超过5至7厘米时，可能会对患者的肾包膜产生牵拉与压迫，进而致使患者出现腰部疼痛症状。此时患者需要前往医院就医，并考虑进行腹腔镜肾囊肿开窗手术治疗。若不能耐受手术，则可以施行肾囊肿抽吸治疗，同时在囊内注射无水乙醇或乙醇胺油酸盐等硬化剂。此外，多数患有肾囊肿的患者往往伴有高血压，所以建议患者在日常生活中要注意监测血压，并且不能过度劳累，以免加重肾脏损伤，对肾脏的代谢能力产生影响。
总之，肾囊肿与腰疼之间的关系因囊肿大小而异，对于肾囊肿患者要注意相关症状及血压情况，根据具体情况选择合适的治疗方法。