斜视眼形成的原因较多，其中先天性因素较为常见，约有15%的斜视是由于先天发育异常导致的。另外，眼部疾病也可能引发斜视，比如先天性白内障，约有1/3的先天性白内障患儿会并发斜视。还有些是因为神经肌肉异常，像支配眼球运动的神经出现麻痹，就可能造成斜视。
先天发育因素导致
遗传因素影响： 如果家族中有斜视病史，后代患斜视的几率会相对较高。研究发现，部分斜视具有一定的遗传倾向，遗传方式可能是多基因遗传。胎儿发育阶段异常： 在胎儿发育的关键时期，如孕期前3个月，若受到病毒感染、接触放射性物质等不良因素影响，可能会干扰眼球外肌的发育，从而增加出生后发生斜视的风险。
眼部疾病引发
屈光不正相关： 高度近视或高度远视的人群，由于眼睛的屈光状态异常，为了看清物体，可能会过度使用眼肌，长期下来容易导致眼位偏斜。比如，高度远视的儿童，如果没有及时佩戴合适的眼镜矫正视力，约有半数可能会发展为内斜视。眼部肿瘤影响： 眼部的一些肿瘤，如眼眶横纹肌肉瘤等，会压迫眼球运动的相关组织，导致眼球运动受限，进而引发斜视。肿瘤体积较小时可能症状不明显，随着肿瘤增大，斜视表现会逐渐突出。
神经肌肉异常所致
动眼神经麻痹： 动眼神经受损时，会影响其所支配的眼外肌运动，常见的表现是眼球运动障碍，出现斜视。例如，颅内动脉瘤压迫动眼神经，就可能导致患侧眼球向外下斜视。展神经麻痹： 展神经主要支配外直肌，展神经麻痹会使外直肌功能丧失，引起内斜视。脑血管意外等疾病可能损伤展神经，从而引发相应的斜视症状。