肾结石的形成是多种因素共同作用的结果。一般来说，尿液中某些物质浓度过高，超过了尿液的溶解限度，就容易析出结晶，逐渐形成肾结石。例如，尿液中钙、草酸、尿酸等成分异常增多时，就增加了肾结石的发生风险。
代谢异常导致
尿液成分异常：当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质排出量增加时，就容易形成结石。比如，尿钙排泄增多，超过了尿液的缓冲能力，就可能形成含钙的肾结石。正常情况下，人体每天尿钙排泄量在一定范围内，如果某些原因导致尿钙增多，像一些内分泌疾病可能影响钙的代谢，就会增加肾结石风险。尿酸代谢紊乱：体内尿酸生成过多或尿酸排泄减少，会使尿酸浓度升高，当尿液中尿酸过饱和时，就容易形成尿酸结石。比如，长期高嘌呤饮食的人，体内尿酸生成增加，若肾脏排泄尿酸功能不佳，就容易引发尿酸结石。
局部因素影响
尿路梗阻：尿路存在梗阻时，尿液排出不畅，尿液中的结晶物质就容易在局部积聚，进而形成结石。例如，输尿管狭窄会导致尿液通过受阻，尿液中的成分就容易沉积形成结石。还有先天性肾盂输尿管连接部狭窄等情况，也会引起尿路梗阻，增加肾结石发生几率。尿路感染：尿路感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使晶体附着沉积，从而形成结石。比如，变形杆菌等细菌能分解尿素产生氨，使尿液碱化，促使磷酸镁铵等结晶析出，引发感染性结石。
生活方式相关
饮水不足：如果每天饮水量少于1500毫升，尿液就会浓缩，导致尿液中矿物质浓度升高，容易形成结石。比如，长期饮水少的人，尿液中钙、草酸等浓度相对较高，就更易析出结晶形成肾结石。饮食不当：高草酸饮食是常见诱因，像菠菜、甜菜、巧克力等富含草酸的食物摄入过多，会使尿液中草酸含量增加，容易形成草酸钙结石。另外，高嘌呤饮食也不好，动物内脏、海鲜等嘌呤含量高，会使尿酸生成增多，增加尿酸结石风险。还有高盐饮食，会导致尿液中钙排泄增加，也可能促进肾结石形成。