男性疱疹主要由单纯疱疹病毒感染引起，治疗上常用抗病毒药物，一般通过规范用药等可控制病情。比如常用的阿昔洛韦等抗病毒药物能起到抑制病毒复制的作用。
常用抗病毒药物
阿昔洛韦： 属于核苷类抗病毒药物，能干扰单纯疱疹病毒DNA多聚酶，从而抑制病毒复制。它对初发的男性生殖器疱疹有较好的治疗作用。伐昔洛韦： 是阿昔洛韦的前体药物，口服后在体内转化为阿昔洛韦发挥作用，生物利用度比阿昔洛韦高，服用相对方便，也能有效抑制疱疹病毒复制。
局部治疗方法
清洁护理： 保持疱疹患处清洁干燥很重要，可以用生理盐水等温和的溶液清洗患处，防止继发细菌感染。比如每天用生理盐水轻柔清洗1 - 2次。外用药物涂抹： 可以使用阿昔洛韦乳膏等外用抗病毒药膏涂抹在疱疹患处，直接发挥抗病毒作用，缓解局部症状。但涂抹时要注意避免接触眼睛等敏感部位。
生活注意事项
休息与饮食： 患病期间要注意休息，保证充足睡眠，一般每天建议休息7 - 8小时以上。同时饮食上要避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、生姜等，也要避免饮酒，这些都可能会加重病情或影响恢复。避免性行为： 在疱疹发作期以及未完全治愈前，要避免性行为，防止病毒传播给性伴侣，一般建议在皮损完全消退、临床症状消失后再考虑恢复性生活，但最好能咨询医生意见。
特殊情况处理
频繁复发者： 如果男性疱疹频繁复发，每年发作6次以上，可以在医生评估后考虑长期抑制疗法，比如长期口服阿昔洛韦等抗病毒药物进行预防，一般需要持续服用较长时间，具体要根据病情由医生制定方案。合并其他疾病者： 如果男性疱疹患者同时合并有其他基础疾病，如艾滋病等免疫功能低下的情况，治疗会相对复杂，需要在治疗疱疹的同时积极治疗基础疾病，并且要加强对疱疹病情的监测和调整治疗方案。