瘦多囊一般是多种因素共同作用导致的。目前认为遗传因素可能起到一定作用，有研究显示约70%的瘦多囊患者存在遗传易感性。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么个体患瘦多囊的风险会增加。比如家族中母亲或姐妹患有多囊，女性后代患瘦多囊的几率比无家族史者高。基因层面关联： 一些特定基因的突变或变异可能与瘦多囊的发生相关，不过具体的基因机制还在不断研究中，但遗传背景是重要的影响因素之一。
内分泌失调因素
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴功能紊乱： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素以及垂体分泌的促性腺激素失衡，会影响卵巢的正常功能。例如垂体分泌的促黄体生成素（LH）水平相对升高，促卵泡生成素（FSH）水平相对降低，打破了正常的激素平衡，导致卵巢排卵异常等问题，进而引发瘦多囊。胰岛素抵抗相关： 即使体重正常，但存在胰岛素抵抗的情况也可能引发瘦多囊。胰岛素抵抗会使身体对胰岛素的敏感性降低，影响糖代谢，进而影响卵巢的内分泌功能，导致雄激素水平升高等一系列改变，促使瘦多囊的发生。
生活方式因素
长期压力过大： 长期处于高压力状态下，会影响神经内分泌系统的调节。比如长期精神紧张、焦虑等，会通过神经递质等影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴，导致激素分泌紊乱，增加瘦多囊的发病风险。有研究发现，长期压力大的女性患瘦多囊的概率比压力较小的女性高约20%。不良饮食习惯： 虽然体型偏瘦，但如果长期饮食不均衡，比如过度节食导致营养摄入不足，或者过多摄入高糖、高脂等不健康食物，也可能影响内分泌和代谢功能，诱发瘦多囊。例如长期高糖饮食会干扰糖代谢，影响胰岛素的作用，进而影响卵巢功能。