自身免疫性甲状腺炎在轻症时通常对身体危害不大，但发展严重时会有多种危害情况，包括：产生压迫症状，形成永久性甲减，引发甲状腺癌，导致发育异常等。
一、压迫症状：自身免疫性甲状腺炎患者若未及时得到有效治疗，就可能出现一些压迫症状，常见的表现为呼吸困难、感觉胸闷等不适状况。
二、形成永久性甲减：当自身免疫性甲状腺炎没有得到有效医治时，患者很可能会形成永久性甲减。这种情况下患者需要终身服药，还可能引发四肢水肿等不良症状。
三、甲状腺癌：自身免疫性甲状腺炎发展到极其严重的阶段会引发甲状腺癌，此时考虑是出现了恶变。需要尽快前往当地医院的甲状腺专科进行全面完善的检查，并根据检查结果积极配合医生治疗，目前主要的治疗方式为药物治疗和手术治疗。
四、发育异常：如果是儿童患上自身免疫性甲状腺炎，可能会致使儿童抵抗力下降，让儿童频繁出现感冒等不良情况，同时儿童还很有可能存在智力和身高发育异常的现象。所以一旦发现儿童患有这种疾病，父母必须引起重视，要积极配合医生进行有效的治疗。
总之，自身免疫性甲状腺炎轻症危害小，但严重时危害较大，应及时治疗以避免不良后果。