霍纳综合征通常是由于颈部及脑干病变影响交感神经通路的任何部位所引起。一般来说，引起霍纳综合征的原因主要有以下几类：
一、颈部病变相关原因
1. 颈部外伤：颈部受到外力撞击等外伤时，可能损伤交感神经通路，从而引发霍纳综合征。比如在车祸中颈部受到撞击，就有可能导致这种情况发生。2. 颈部肿瘤：颈部的一些肿瘤，如神经鞘瘤等，随着肿瘤的生长，可能会压迫交感神经，进而引起霍纳综合征。肿瘤不断增大占据空间，对交感神经造成压迫是常见的致病因素之一。
二、颅内病变相关原因
1. 脑干病变：脑干是交感神经通路的重要部位，当脑干发生病变，像脑干梗死时，就可能影响交感神经传导，导致霍纳综合征。例如脑梗死发生在脑干区域，就有可能引发该病症。2. 颅内肿瘤：颅内的肿瘤，如松果体区肿瘤等，若肿瘤生长累及交感神经通路相关结构，也会引起霍纳综合征。肿瘤对周围神经结构的侵犯是导致发病的原因之一。
三、其他原因
1. 颈部手术并发症：在颈部进行某些手术时，如甲状腺手术等，有可能损伤交感神经，从而引发霍纳综合征。手术过程中对交感神经的误伤是导致该病症的一个可能情况。2. 先天性因素：少数情况下，先天性的交感神经发育异常也可能导致霍纳综合征。比如胚胎发育时期交感神经发育出现异常，就可能在出生后表现出霍纳综合征的相关症状。