消化不好可以选择的药物有多种，比如促胃肠动力药多潘立酮，一般能在15-30分钟左右起效，促进胃肠蠕动。
促胃肠动力药
多潘立酮：能直接作用于胃肠壁，增加食管下括约肌张力，促进胃排空，缓解腹胀、打嗝等症状，适用于因胃肠蠕动缓慢导致消化不好的人群。莫沙必利：通过兴奋胃肠道胆碱能中间神经元及肌间神经丛的5-羟色胺受体，促进乙酰胆碱释放，增强胃肠道运动，改善消化不良症状。
助消化药
健胃消食片：由太子参、陈皮、山药等中药组成，能促进消化液分泌，增强胃蠕动，帮助消化，没有明显的年龄禁忌，但儿童服用需遵医嘱减量。乳酶生：是活肠球菌的干燥制剂，在肠内分解糖类生成乳酸，使肠内酸度增高，从而抑制腐败菌的生长繁殖，并防止肠内发酵，减少产气，适用于消化不良、腹胀及小儿饮食失调所引起的腹泻、绿便等。
抑酸护胃药
奥美拉唑：属于质子泵抑制剂，能特异性地抑制胃壁细胞顶端膜构成的分泌性微管和胞浆内的管状泡上的H+-K+-ATP酶，从而有效地抑制胃酸的分泌，对于因胃酸过多导致消化不好，出现烧心、反酸等症状的人适用，但长期使用需在医生指导下进行，孕妇、哺乳期妇女慎用。铝碳酸镁：能迅速中和胃酸，并保持很长一段时间，同时还能吸附和结合胆汁，保护胃黏膜，缓解消化不良引起的胃痛、胃灼热感（烧心）、反酸等症状。
调节肠道菌群药
双歧杆菌四联活菌片：含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等四种有益菌，能补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，改善因肠道菌群失调引起的消化不好，儿童、成人都可服用，服用时需用温水送服，避免温度过高杀死活菌。地衣芽孢杆菌活菌胶囊：以活体肠道益生菌制成，可调整肠道菌群，适用于因肠道菌群失调导致的肠功能紊乱引起的消化不好。