扁桃体发炎伴咳嗽是一种常见的病症，需要根据具体情况选择合适的药物进行治疗。以下是一些常用的药物：
1.抗生素：如果是细菌感染引起的扁桃体发炎，医生可能会开抗生素，如头孢克洛、阿莫西林等。使用抗生素时要按照医生的建议服用，不要自行停药。
2.退烧药：如果宝宝体温超过38.5℃，可以使用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚。但要注意，退烧药只能缓解症状，不能治愈疾病。
3.止咳药：如果咳嗽严重，可以使用止咳药，如氨溴索、右美沙芬等。但要注意，6岁以下儿童不建议使用止咳药。
4.中药：一些中药也可以治疗扁桃体发炎伴咳嗽，如双黄连口服液、蒲地兰消炎口服液等。但要注意，中药的使用需要在医生的指导下进行。
需要注意的是，以上药物仅供参考，具体用药需要根据宝宝的年龄、体重、病情等因素来确定。在给宝宝用药之前，最好先咨询医生的意见，避免自行用药。同时，还需要注意宝宝的饮食和休息，多喝水，多吃蔬菜水果，避免吃辛辣、油腻、刺激性的食物，保持室内空气流通。如果宝宝的症状持续加重或出现其他异常情况，应及时就医。