巧克力囊肿单纯靠中药不能完全治愈，需结合药物、手术等方式治疗，且要及时治疗以免贻误病情。
一、中药调理：巧克力囊肿喝中药可起到一定调理作用及缓解症状。中医辨证将其分为气滞血瘀型、瘀血阻络型、气虚血瘀型等，可在辨证后分别使用血府逐瘀汤、桂枝茯苓丸、四君子汤和大黄蛰虫丸进行治疗来缓解相关症状。
1.血府逐瘀汤：主要针对气滞血瘀型，能起到活血化瘀等作用。
2.桂枝茯苓丸：适用于瘀血阻络型，可帮助通经化瘀等。
3.四君子汤和大黄蛰虫丸：对气虚血瘀型有一定疗效，可益气活血等。
二、手术治疗：建议立即进行手术，及时做囊肿剥除手术，以防宫腔粘连或出现子宫内膜异位症。在手术中要尽量保护卵巢功能以免影响生育，术后还需积极进行抗感染治疗。
总之，当发现有巧克力囊肿时，一定要尽快就诊并积极治疗，选择合适的方法来处理，避免病情被延误。