新生儿巨细胞病毒感染是可以治疗的。目前常用更昔洛韦等抗病毒药物进行治疗，一般经过规范治疗，大部分新生儿巨细胞病毒感染可以得到控制。
常用治疗药物及作用
更昔洛韦： 是治疗新生儿巨细胞病毒感染的常用抗病毒药物，它能抑制巨细胞病毒的DNA合成，从而发挥抗病毒作用。膦甲酸钠： 对于一些对更昔洛韦耐药的情况可能会使用膦甲酸钠，它通过非竞争性抑制病毒DNA多聚酶的焦磷酸盐结合位点来发挥作用。
治疗的时间周期
一般来说，治疗周期需要根据新生儿的具体病情来定。通常可能需要持续用药数周，比如可能需要用药2-3周左右，但具体时间要医生根据患儿的病毒载量、临床症状等多方面因素来综合判断调整。
治疗中的注意事项
定期监测： 在治疗过程中需要定期监测新生儿的血常规、肝功能等指标。因为更昔洛韦等药物可能会对骨髓造血功能有一定影响，也可能影响肝功能，所以要通过监测血常规看白细胞、血小板等情况，通过肝功能检查看转氨酶等指标是否异常。特殊新生儿情况： 对于早产儿或者有基础疾病的新生儿，在使用药物治疗时要更加谨慎。早产儿的各器官功能发育还不完善，药物代谢和排泄能力较差，需要医生根据其体重、胎龄等精确评估药物的使用剂量和时机；有基础疾病的新生儿本身身体状况较为复杂，药物的相互作用等情况需要特别考量。
治疗后的随访
病毒学检测： 在治疗结束后需要定期进行巨细胞病毒的相关检测，比如检测血清中的巨细胞病毒DNA等，以确定病毒是否被完全清除，一般可能需要在治疗后1个月、3个月等不同时间点进行检测。生长发育评估： 还要关注新生儿的生长发育情况，因为巨细胞病毒感染可能会对新生儿的生长发育产生影响，比如影响体重增长、智力发育等，所以要定期对新生儿的身长、体重、神经心理发育等方面进行评估，确保新生儿能够健康成长。