甲状腺肿瘤的引起因素较为复杂，目前研究认为可能与以下多方面因素相关。甲状腺肿瘤的发生是多种因素综合作用的结果。
遗传因素相关
某些遗传综合征： 有一些遗传性综合征与甲状腺肿瘤的发生密切相关。例如，多发性内分泌腺瘤病2型（MEN2型），这是一种常染色体显性遗传病，患者体内存在RET原癌基因的突变，使得患甲状腺髓样癌的风险显著增加。据统计，MEN2型家族中，约50% - 70%的患者会发生甲状腺髓样癌。家族聚集现象： 如果家族中有亲属患甲状腺肿瘤，那么其他家族成员患甲状腺肿瘤的风险会比普通人群高。虽然具体的遗传传递方式和相关基因位点还在不断研究中，但家族聚集性提示遗传因素在甲状腺肿瘤发生中起到一定作用。
放射性暴露因素
儿童期颈部放射性照射史： 儿童时期如果因某些疾病接受过颈部的放射性治疗，比如因扁桃体炎、胸腺肥大等疾病进行颈部X线、γ射线等放射性照射，会明显增加甲状腺肿瘤的发生风险。研究发现，儿童期颈部接受过放射性照射的人群，甲状腺癌的发病风险比未接受过照射的人群高5 - 10倍。职业性放射性暴露： 一些长期处于放射性环境中的职业人群，如核电站工作人员、医疗放射科工作人员等，如果没有做好防护措施，也容易受到放射性物质的影响，从而增加甲状腺肿瘤的发生几率。他们长期接触放射性物质，会导致甲状腺细胞的DNA损伤，进而引发细胞的异常增殖，增加患甲状腺肿瘤的可能性。
激素水平相关
促甲状腺激素（TSH）长期刺激： 当人体长期处于TSH水平升高的状态时，会促进甲状腺细胞的增殖。例如，地方性甲状腺肿地区的人群，由于饮食中缺碘，导致甲状腺激素合成减少，反馈性引起垂体分泌大量TSH，长期的TSH刺激会使甲状腺滤泡上皮细胞增生，增加甲状腺肿瘤的发生风险。研究表明，TSH水平持续升高超过一定时间后，甲状腺肿瘤的发病风险会明显上升。雌激素水平影响： 女性体内的雌激素水平变化与甲状腺肿瘤的发生也有关系。在女性的月经周期、妊娠、更年期等不同阶段，雌激素水平波动较大。有研究发现，女性患甲状腺肿瘤的几率相对男性较高，可能与雌激素对甲状腺细胞的刺激作用有关。雌激素可以通过与甲状腺细胞上的雌激素受体结合，影响甲状腺细胞的生长和分化，从而在一定程度上增加甲状腺肿瘤发生的可能性。