附件囊肿是否需要手术不能一概而论，一般直径小于5厘米且无明显症状的附件囊肿，约有1/3可能是生理性的，比如卵泡囊肿或黄体囊肿，可在月经干净后复查，通常2~3个月后可能自行消失，这种情况不需要手术。但如果附件囊肿直径大于5厘米，或持续存在超过3个月，或怀疑有恶变可能，通常需要手术治疗。
生理性附件囊肿的情况
卵泡囊肿： 是最常见的生理性附件囊肿，多发生在月经周期的特定阶段，一般直径多在2~5厘米，多数无明显症状，常于超声检查时偶然发现，多数可在2~3个月经周期内自然消退，通常不需要手术干预，定期复查超声观察变化即可。黄体囊肿： 也是生理性的，多在排卵后形成，一般直径一般小于5厘米，部分人可能会有下腹部隐痛等症状，但大多能自行吸收消退，同样可通过定期复查超声监测，无需急于手术。
病理性附件囊肿的情况
子宫内膜异位囊肿： 属于病理性附件囊肿，多与子宫内膜异位症有关，囊肿内含有类似巧克力样的陈旧血性液体，患者多有痛经进行性加重、不孕等表现，若囊肿较大（直径常大于5厘米），或药物治疗无效，通常需要手术治疗，手术方式包括腹腔镜手术等。浆液性囊腺瘤或黏液性囊腺瘤： 属于常见的卵巢上皮性肿瘤，多为良性，但有一定恶变倾向，一般一旦发现囊肿直径超过5厘米，就建议手术切除，因为随着囊肿增大，发生破裂、扭转等并发症的风险会增加，手术可通过腹腔镜或开腹进行。畸胎瘤： 大多为良性，但也有恶变可能，通常建议手术切除，尤其是成熟畸胎瘤中有一种皮样囊肿，虽为良性，但瘤内可能包含毛发、牙齿等组织，随着瘤体增大可能会发生扭转等急腹症情况，所以一般诊断明确后多建议手术治疗。