泌尿系统感染主要是由细菌等病原体入侵泌尿系统引起的。其中，大肠埃希菌是最常见的致病菌，约占泌尿系统感染致病菌的80%左右。
病原体入侵途径
上行感染：这是最主要的感染途径。细菌从尿道外口进入尿道，然后沿着尿道上行，经过膀胱、输尿管，甚至到达肾脏。比如女性的尿道短而直，长度约3 - 5厘米，相比男性更容易发生上行感染。性生活时容易将尿道口周围的细菌挤入尿道，从而引发感染。血行感染：较少见。身体其他部位的感染病灶，比如皮肤感染、扁桃体炎等，细菌可通过血液循环到达泌尿系统引发感染。例如，金黄色葡萄球菌菌血症时，细菌可随血流到达肾脏和尿路其他部位引起感染。淋巴道感染：更为罕见。盆腔和下腹部的器官感染时，细菌可通过淋巴管传播到泌尿系统。比如结肠炎时，细菌可能通过淋巴管蔓延至泌尿系统。
易感人群因素
女性：女性由于生理结构特点，尿道短、宽且直，距离肛门近，肛门周围的细菌容易污染尿道，所以女性泌尿系统感染的发生率明显高于男性。尤其是育龄女性，怀孕时输尿管蠕动减慢，容易导致尿液潴留，增加感染风险；绝经后的女性，雌激素水平降低，尿道黏膜变薄，局部抵抗力下降，也容易发生泌尿系统感染。泌尿系统结构异常：如果存在泌尿系统结石、肿瘤、畸形等情况，会影响尿液的正常排出，使尿液潴留，为细菌滋生提供了良好的环境，从而容易引发感染。比如尿路结石会阻碍尿液流动，导致尿液在局部积聚，细菌大量繁殖，引发感染。机体免疫力低下：患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂的人群，机体抵抗力下降，容易受到病原体侵袭。糖尿病患者血糖高，有利于细菌生长繁殖；艾滋病患者免疫系统受损，抵御病原体的能力大大减弱，更容易发生泌尿系统感染。医源性因素：进行导尿、膀胱镜检查等操作时，如果消毒不严格，可能会将外界细菌带入泌尿系统，引起感染。比如导尿时间超过3天，泌尿系统感染的发生率会显著增加，超过10天的话，感染率可高达90%以上。