特发性血小板减少性紫癜的病因目前尚未完全明确，可能与自身免疫、感染等因素有关。一般认为，自身免疫因素是较为重要的原因，约80%的患者体内可检测到血小板相关抗体。感染也可能是诱因之一，比如病毒感染，像风疹病毒、麻疹病毒等感染后，可能会引发机体的免疫反应，进而导致特发性血小板减少性紫癜。
自身免疫因素相关
自身抗体产生： 人体免疫系统出现异常时，会错误地产生针对自身血小板的抗体。这些抗体就像“敌人”一样，会攻击自身的血小板，导致血小板被破坏。例如，体内的B淋巴细胞可能会产生过多针对血小板膜糖蛋白的自身抗体，使得血小板在血管内被单核 - 巨噬细胞系统吞噬破坏，从而引起血小板数量减少。免疫调节异常： 机体的免疫调节机制出现紊乱，T淋巴细胞的功能也可能发生改变。正常情况下，T淋巴细胞能够调节B淋巴细胞产生抗体的过程，但在特发性血小板减少性紫癜患者体内，T淋巴细胞的这种调节功能失常，导致B淋巴细胞过度活化，产生大量攻击血小板的抗体，进一步加重血小板的减少。
感染因素相关
病毒感染引发： 某些病毒感染后容易诱发特发性血小板减少性紫癜。比如，儿童在感染风疹病毒后，约1 - 3周左右可能会出现血小板减少的情况。这是因为病毒感染机体后，会改变血小板的抗原性，使得机体免疫系统将血小板识别为外来异物进行攻击。另外，麻疹病毒感染后也可能通过类似的机制，引发自身免疫反应攻击血小板。细菌感染关联： 一些细菌感染也可能与特发性血小板减少性紫癜有关。虽然相对病毒感染来说，细菌感染引发的比例可能稍低，但像幽门螺杆菌感染，也被发现可能在某些患者中起到诱发作用。细菌感染后，细菌的某些成分可能作为抗原，刺激机体免疫系统产生相关抗体，这些抗体在攻击细菌的同时，可能交叉反应攻击血小板，导致血小板减少。
其他可能因素
遗传因素影响： 有研究发现，特发性血小板减少性紫癜可能存在一定的遗传易感性。某些遗传基因的突变或多态性可能会增加个体患特发性血小板减少性紫癜的风险。不过，目前对于具体的遗传关联位点和机制还在进一步研究中，但可以确定遗传因素在其中起到了一定作用，比如某些家族中可能有多人患病的情况，就提示了遗传方面的影响。雌激素作用： 女性患者相对较多，尤其是在青春期和育龄期。这可能与雌激素有关。雌激素能够抑制血小板的生成，还可能增强单核 - 巨噬细胞系统对血小板的吞噬作用。在女性的不同生理阶段，雌激素水平波动较大，当雌激素水平升高时，可能更容易诱发特发性血小板减少性紫癜或者使病情加重，这也是女性患者相对高发的一个可能原因。