茎突过长综合征主要通过手术等方式处理，一般手术是主要的治疗手段。比如对于有明显临床症状且经检查确诊茎突过长的患者，多需要考虑手术切除过长的茎突。
手术治疗方式
经口内径路手术：这是比较常用的手术方式。通过口腔入路，在扁桃体窝处做切口，暴露茎突，然后将过长的茎突截断并取出。这种手术方式相对来说面部不会留下明显疤痕，但对手术操作要求较高，需要精准操作。颈外径路手术：从颈部做切口进行手术。适用于茎突过长明显且经口内手术困难等情况。不过颈部手术会在颈部留下一定的手术瘢痕。
非手术缓解方法
药物对症治疗：当患者有疼痛等症状时，可使用非甾体类抗炎药来缓解疼痛，比如布洛芬等，它能通过抑制前列腺素的合成起到抗炎、止痛的作用，但只能暂时缓解症状，并不能从根本上解决茎突过长的问题。局部理疗：可以采用热敷等理疗方式，促进局部血液循环，在一定程度上可能会减轻因茎突过长带来的局部不适症状。不过理疗的效果因人而异，一般作为辅助的缓解手段。
术后注意事项
饮食方面：术后短期内要吃软食，比如米粥、面条等，避免吃坚硬、辛辣刺激性食物，防止刺激手术部位，影响伤口愈合。一般术后1 - 2周内都要注意饮食的软烂程度。口腔卫生：要保持口腔清洁，勤漱口，防止口腔内细菌感染手术部位。可以使用生理盐水或漱口水漱口，每天多次。定期复查：按照医生要求定期复查，一般术后1个月、3个月等都需要复查，观察伤口愈合情况以及茎突切除后的恢复情况等。