牙周炎治疗常用的药物主要有抗菌药物、抗炎药物等。一般来说，抗生素类药物在牙周炎治疗中较为常用，比如硝基咪唑类药物中的甲硝唑，它能抑制厌氧菌生长，但通常需要在医生指导下使用，一般用药疗程需遵循医嘱。
常用抗菌药物
甲硝唑： 属于硝基咪唑类抗菌药，对厌氧菌有较好的抑制作用，可用于牙周炎伴有厌氧菌感染的情况，能帮助减轻牙龈炎症、消除牙周袋内的细菌感染，但使用时要注意可能出现胃肠道不适等不良反应，且孕妇及哺乳期妇女需谨慎使用。阿莫西林： 是广谱青霉素类抗生素，与甲硝唑联合使用时，可增强对牙周炎相关细菌的抗菌效果，不过对青霉素过敏者禁用，使用前需做青霉素皮试。
抗炎药物
布洛芬： 属于非甾体类抗炎药，具有解热、镇痛、抗炎的作用，能缓解牙周炎引起的牙龈肿痛等疼痛症状，一般每次服用剂量需按照说明书或医嘱来，胃肠道溃疡患者慎用。双氯芬酸钠缓释片： 同样为非甾体类抗炎药，抗炎镇痛效果也比较好，可用于减轻牙周炎导致的炎症反应和疼痛，但可能会引起胃肠道刺激等不良反应，有胃肠道疾病史者要特别注意。
局部用药
米诺环素凝胶： 属于局部用的抗菌药物，将其涂抹在牙周袋内，能直接作用于牙周袋内的细菌，持续释放药物来抑制细菌生长，减轻牙周炎症，使用相对方便，局部不良反应相对较少，但也需在医生操作下使用。氯己定含漱液： 是常用的口腔含漱剂，能抑制牙菌斑形成，减少口腔内细菌数量，辅助治疗牙周炎，一般每天含漱几次，能帮助保持口腔清洁，减轻牙龈炎症，但长期使用可能会导致牙齿、舌苔染色，停药后可逐渐恢复。
用药注意事项
牙周炎的药物治疗只是综合治疗的一部分，还需要配合洗牙、龈下刮治等牙周基础治疗。而且不同患者的病情不同，用药方案也会有差异，比如病情较轻的患者可能单纯通过局部用药就能控制炎症，而病情较重的可能需要全身用药联合局部治疗。同时，用药过程中要密切观察身体反应，若出现严重不良反应应及时就医调整治疗方案。