植物神经功能紊乱的药物治疗需根据具体症状来选择，一般可使用调节植物神经功能的药物等。比如常用的有维生素B1，它能参与神经递质的合成等过程，对植物神经有一定调节作用。
调节植物神经功能的药物
谷维素： 可以调节植物神经功能失调及内分泌平衡障碍，一般来说，成人常用剂量是一次10 - 30毫克，一日3次。它能改善精神神经症状，对植物神经功能紊乱引起的失眠、焦虑等有一定帮助。维生素B族： 像维生素B1、维生素B6等都属于此类。维生素B1参与体内辅酶的形成，能维持神经、心脏及消化系统正常功能；维生素B6参与氨基酸代谢等多种生理过程。通常维生素B1一次10毫克，一日3次；维生素B6一次10 - 20毫克，一日3次。它们可以辅助调节植物神经功能。
对症治疗的药物
改善睡眠的药物： 如果植物神经功能紊乱导致严重失眠，可短期使用一些助眠药物，比如艾司唑仑。但这类药物属于处方药，需要在医生指导下使用，一般不建议长期大量服用。艾司唑仑成人常用量一次1 - 2毫克，睡前服用。调节心血管症状的药物： 当植物神经功能紊乱引起心悸等心血管症状时，若心率较快，可在医生评估下使用β受体阻滞剂，如普萘洛尔。但使用时要注意，哮喘患者等需谨慎，它一般一次10 - 30毫克，一日3次，需根据心率等情况调整剂量。
中药调理相关药物
逍遥丸： 具有疏肝健脾、养血调经的作用，对于植物神经功能紊乱因肝郁脾虚引起的症状有一定改善作用。一般一次6 - 9克，一日1 - 2次。它能调节情绪，缓解因植物神经功能紊乱导致的情绪不佳等情况。归脾丸： 有益气补血、健脾养心的功效，适用于植物神经功能紊乱出现心悸怔忡、失眠多梦、头昏头晕等心脾两虚症状的人群。一次8 - 10丸，一日3次。可以改善身体虚弱、睡眠不好等问题，辅助调节植物神经功能。