扁桃体一直发炎可能与多种因素有关。一般来说，人体免疫力低下时，比如儿童免疫系统发育尚不完善，就更容易出现扁桃体反复发炎的情况，有研究显示，儿童扁桃体反复发炎的概率相对较高。
病原体持续存在
细菌感染： 最常见的是A组乙型溶血性链球菌持续感染，这种细菌会长期潜伏在扁桃体隐窝内，不断引发炎症反应。病毒感染： 像EB病毒等病毒也可能持续侵袭扁桃体，导致扁桃体一直发炎，而且病毒感染后机体免疫清除较慢，容易反复。
自身免疫因素
免疫紊乱： 当自身免疫系统出现紊乱时，会错误地将扁桃体组织当作攻击目标，持续对其进行攻击，从而引发扁桃体一直发炎的状况。比如一些自身免疫性疾病患者，扁桃体发炎的概率会增加。过敏反应： 若是对空气中的某些过敏原，如花粉、尘螨等过敏，接触后可能引发扁桃体的过敏炎症反应，若持续接触过敏原，就会导致扁桃体一直发炎。
局部因素未消除
隐窝堵塞： 扁桃体隐窝口堵塞，分泌物引流不畅，就容易滋生细菌等病原体，导致扁桃体反复发炎。例如食物残渣、细菌等堆积在隐窝内，长期刺激扁桃体。邻近器官影响： 邻近器官的炎症也可能波及扁桃体，如鼻窦炎、咽炎等，如果这些邻近器官的炎症没有得到有效控制，就会影响扁桃体，导致其一直发炎。比如鼻窦炎患者，鼻腔分泌物倒流刺激扁桃体，引发炎症反复。