宝宝扁桃体发炎咳嗽时，选择合适的药物可以缓解症状，但需要在医生的指导下使用。以下是一些常用的药物：
1.抗生素：如果宝宝的扁桃体发炎是由细菌感染引起的，医生可能会开抗生素来治疗，如阿莫西林、头孢呋辛酯等。
2.退烧药：如果宝宝发烧，体温超过38.5°C，可以使用退烧药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
3.止咳药：如果宝宝咳嗽严重，可以使用止咳药，如氨溴索、氨溴特罗等。
4.清热解毒药：一些清热解毒的中药，如蒲地蓝消炎口服液、双黄连口服液等，也可以缓解扁桃体发炎的症状。
需要注意的是，药物的使用剂量和使用时间应根据宝宝的年龄、体重和具体病情来确定。同时，还应注意宝宝的饮食和休息，多喝水，多吃蔬菜水果，避免吃辛辣、油腻、刺激性的食物。如果宝宝的症状持续加重或出现其他不适，应及时就医。