口舌生疮可以根据不同情况选择合适药物，一般来说，局部用药可缓解症状，比如西瓜霜喷剂，它能在数小时内起到一定的止痛、促进愈合作用。
局部外用药
西瓜霜喷剂：主要成分有西瓜霜、硼砂等，具有清热解毒、消肿止痛的功效，可直接喷于口舌生疮处，能快速缓解疼痛，一般用药后1 - 2小时能感觉到疼痛减轻，促进创面愈合。冰硼散：由冰片、硼砂等组成，撒于口舌生疮部位，有清热止痛的作用，使用后能在较短时间内让疼痛有所缓解，帮助疮面恢复，但儿童使用需谨慎，因为其有一定刺激性。
维生素类药物
维生素B2：当身体缺乏维生素B2时容易引发口舌生疮，一般每天补充1 - 2次，每次5 - 10毫克，连续补充数天，能从根源上改善因缺乏维生素B2导致的口舌生疮情况。通常补充后3 - 7天可见到疮面逐渐愈合的迹象。复合维生素B：里面含有多种B族维生素，对于因B族维生素缺乏引起的口舌生疮有综合调理作用，一般成人每次服用1 - 3片，每天3次，服用后能补充身体所需的多种维生素，促进口舌生疮的恢复。
清热解毒类中成药
牛黄解毒片：具有清热解毒的作用，对于火热内盛引起的口舌生疮、牙龈肿痛等有一定疗效。但孕妇禁用，且不宜长期大量服用。一般成人一次服用3片左右，每天2 - 3次，服用后能在一定程度上减轻口舌生疮的红肿热痛等症状。黄连上清丸：有清热通便、散风止痛的功效，对于口舌生疮伴有咽喉肿痛、大便干结等情况有较好的作用，成人每次服用6克左右，每天2次，服用后能缓解口舌生疮相关的一系列不适症状。