肝内胆管结石的治疗方法主要有手术治疗、药物治疗等。一般来说，手术是去除肝内胆管结石的主要手段，但具体治疗需根据病情等因素决定。
手术治疗方式
肝切除术：
局部肝切除术：如果结石局限在某一段或某一叶的肝内胆管，可切除病变的肝组织。比如结石集中在左外叶，就可以做左外叶切除术。这种手术能直接清除结石所在部位的病变组织，减少结石复发的可能。肝部分切除术：对于肝内胆管结石合并明显肝纤维化、萎缩的情况，切除相关部分的肝脏是有效的方法。例如，当某一肝段出现严重的胆管扩张、结石堆积且伴有肝脏萎缩时，通过切除该肝段来解决问题。
胆肠吻合术：
肝管空肠Roux - en - Y吻合术：适用于肝内胆管结石导致胆管狭窄等情况。通过将肝内胆管与空肠进行吻合，建立胆汁引流通道，使胆汁能够顺利排出，降低胆管内压力，预防结石再次形成。这种手术可以改善胆汁的引流，减少结石在胆管内淤积的风险。
药物辅助治疗
利胆药物：
熊去氧胆酸：可以增加胆汁分泌，改变胆汁成分，降低胆汁中胆固醇及胆固醇酯的含量，从而有利于小的肝内胆管结石的溶解。一般需要长期服用，但要注意定期监测肝功能等指标。消炎利胆片：具有清热、祛湿、利胆的作用，能缓解肝内胆管结石引起的胆管炎等症状，减轻胆道炎症反应，辅助控制病情。不过，它不能完全溶解结石，多作为辅助治疗手段。
内镜治疗
经内镜逆行胰胆管造影（ERCP）：
取石治疗：对于肝内胆管结石位于肝外胆管或靠近肝门部的部分结石，可以通过ERCP技术，插入内镜至十二指肠乳头，找到胆管开口，然后插入取石网篮或球囊等工具取出结石。但对于肝内较深部位的结石，ERCP取石可能有一定局限性。放置胆管支架：如果肝内胆管结石导致胆管狭窄，可在ERCP下放置胆管支架，解除胆管狭窄，恢复胆汁通畅，防止结石进一步堆积。不过，支架可能会有堵塞等并发症，需要定期随访。