胃肠神经官能症是一种常见的功能性胃肠病，其症状表现多样。一般来说，患者可能会出现约数周或数月反复发作的症状。
胃肠道症状表现
腹痛： 疼痛部位不固定，多为脐周附近，程度轻重不一，有的患者疼痛较轻微，仅感觉腹部有不适感，有的则疼痛较为明显，但通常不会有压痛等阳性体征。腹胀： 患者常自觉腹部胀满，尤其是在进食后较为明显，有时可伴有腹部膨隆的表现，但腹部触诊柔软，无明显包块。
消化系统伴随症状
恶心呕吐： 可能在进食后出现恶心，严重时会发生呕吐，呕吐物多为胃内的容物，一般无血性或胆汁样物质。食欲不振： 患者对食物的欲望降低，食量明显减少，长期可能会导致体重有所下降。
全身神经功能紊乱症状
失眠多梦： 患者夜间睡眠质量差，难以入睡，即使入睡也容易惊醒，多梦，导致白天精神萎靡，注意力不集中。焦虑抑郁： 部分患者会出现情绪方面的问题，表现为焦虑不安，对事物缺乏兴趣，严重时可能达到抑郁的状态，情绪低落，对未来缺乏信心。
其他表现
排便异常： 有的患者会出现腹泻，大便次数增多，质地较稀；有的则表现为便秘，大便干结，排便困难，而且腹泻与便秘可能会交替出现。