上口腔溃疡的原因有多种。一般来说，维生素缺乏是常见原因之一，比如人体缺乏维生素B₂时，大约2-3周左右就可能出现口腔溃疡。
局部创伤因素
咬伤导致： 比如吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就容易引发口腔溃疡，这种情况在咀嚼功能不太协调的人群中较常见，像儿童就比较容易出现因咬伤引起口腔溃疡的情况。刷牙损伤： 刷牙时用力过猛，不小心划伤口腔内壁，也会形成口腔溃疡，尤其是使用硬毛牙刷的人群更易发生这种情况。
免疫系统问题
自身免疫性疾病： 像白塞病就会反复出现口腔溃疡，这类患者的免疫系统会错误地攻击自身组织，导致口腔等部位频繁出现溃疡，通常溃疡会比较严重，且愈合时间较长。免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如长期熬夜、过度劳累后，身体的抵抗力下降，就容易受到病菌侵袭，从而引发口腔溃疡，一般这种情况持续1-2周可能会出现溃疡症状。
systemic因素
内分泌变化： 女性在月经前后，体内雌激素水平发生变化，就可能出现口腔溃疡，有研究发现，约30%-40%的女性会在月经前期出现口腔溃疡发作的情况。某些疾病影响： 患有胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎等胃肠道疾病时，也可能伴随口腔溃疡的发生，这是因为胃肠道功能紊乱影响了营养物质的吸收和身体的代谢，进而导致口腔黏膜抵抗力下降引发溃疡。