阴茎里面偶尔隐隐作痛可能由以下原因引起：
1.尿道炎：由细菌、真菌、病毒等感染引起，除了阴茎里面隐痛，还可能出现尿频、尿急、尿痛等症状。可以使用抗生素（如头孢呋辛酯、左氧氟沙星）进行治疗。
2.前列腺炎：常见于中青年男性，可由细菌感染或其他原因引起，除了阴茎隐痛，还可能伴有会阴部、耻骨上区、腹股沟区等部位的疼痛不适，以及排尿异常、性功能障碍等症状。治疗方法包括使用抗生素（如左氧氟沙星、阿奇霉素）、α-受体阻滞剂（如坦索罗辛）、非甾体抗炎镇痛药（如塞来昔布）等。
3.阴茎硬结症：是一种发生在阴茎海绵体白膜的纤维化疾病，可能与遗传、损伤、感染等因素有关，主要表现为阴茎勃起时疼痛、弯曲畸形，严重者可影响性生活。目前没有特效的治疗方法，症状轻者可以通过局部注射药物、物理治疗等缓解症状，严重者需要手术治疗。
4.其他：阴茎里面偶尔隐隐作痛还可能与包茎、包皮过长、精索静脉曲张、附睾炎、输精管炎等疾病有关。
需要注意的是，引起阴茎里面偶尔隐隐作痛的原因较多，且可能会影响男性的生殖健康和性功能。如果出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，在治疗期间应注意个人卫生，避免性生活，避免食用辛辣刺激性食物，多喝水，勤排尿。