胃肠功能紊乱的症状多样，常见的有消化系统方面的表现。比如，约半数以上的患者会出现腹胀，这种腹胀可能会持续数小时甚至数天。
消化系统症状表现
腹痛： 疼痛部位不固定，多为隐痛或胀痛，一般程度较轻，有的患者可能会在进食后加重，但也有部分人疼痛与进食无关。例如，有的患者会感觉上腹部隐隐作痛，自己很难准确指出具体痛点。腹泻： 每日排便次数可增多，一般在3 - 5次左右，大便性状多为稀糊状，有的可能含有不消化的食物，但无脓血。还有些患者会出现便秘情况，排便困难，粪便干结如羊粪状。
全身伴随症状
失眠、焦虑等精神症状： 由于胃肠功能紊乱，患者往往会伴有精神方面的问题。大约有三分之一的患者会出现失眠现象，入睡困难或者睡眠浅易惊醒。同时，还可能出现焦虑情绪，总是担心胃肠状况，影响日常生活和工作。比如，有的患者会整天忧心忡忡，觉得自己的胃肠问题无法解决。疲劳乏力： 患者会感觉浑身没劲儿，即使没有进行大量体力活动，也会时常感到疲劳，影响日常的体力和精力状态。比如，原本能轻松完成的家务，现在做起来会觉得很吃力。
不同人群的特殊表现
儿童胃肠功能紊乱： 儿童可能会表现出食欲减退，不想吃东西，食量明显减少。有的还会出现呕吐情况，多为非喷射性呕吐，吐出胃内容物。比如，2 - 6岁的儿童可能会突然不想吃饭，偶尔还会呕吐。老年胃肠功能紊乱： 老年患者除了有上述一般症状外，可能更容易出现营养不良的情况。因为胃肠功能不好，影响营养吸收，会导致体重逐渐下降，身体抵抗力也会降低，容易引发其他疾病。例如，很多老年胃肠功能紊乱患者会变得消瘦，面色萎黄。