神经紊乱的原因有多种。一般来说，长期的精神压力过大是常见原因之一，比如一些人在工作中面临高强度的竞争，长期处于高度紧张状态，持续3~6个月甚至更久，就可能引发神经紊乱。
一、遗传因素相关
遗传易感性： 部分神经紊乱具有一定的遗传倾向。研究发现，如果家族中有近亲患有神经紊乱相关疾病，如焦虑症等，那么家族中的其他成员患神经紊乱的风险会比正常人群高出2~3倍。但这并不是绝对的，只是遗传因素增加了患病的可能性。基因变异影响： 某些特定基因的变异也可能与神经紊乱的发生有关。例如，与神经递质合成、代谢相关的基因发生变异时，会干扰神经递质的正常功能，从而增加神经紊乱的发病几率。不过目前对于具体哪些基因变异与哪些神经紊乱类型相关还在进一步研究中。
二、生理因素方面
内分泌失调： 当人体内分泌系统出现紊乱时，比如甲状腺功能亢进或减退，就可能影响神经系统的正常功能。甲状腺激素对神经系统的发育和功能维持起着重要作用，甲状腺功能亢进时，过多的甲状腺激素会使神经兴奋性增高，容易出现焦虑、烦躁等神经紊乱症状；甲状腺功能减退时，神经兴奋性降低，可能导致嗜睡、情绪低落等神经紊乱表现。一般这种内分泌失调可能持续数月甚至更长时间才会逐渐显现出神经紊乱的症状。脑部疾病影响： 一些脑部疾病也会引发神经紊乱。例如，脑外伤后，无论是轻度还是重度脑外伤，都可能导致神经功能紊乱。脑外伤后的3~12个月内，部分患者会出现头痛、失眠、注意力不集中等神经紊乱的表现。还有脑部的肿瘤、脑血管疾病等，当病变影响到神经系统的结构和功能时，也会引发神经紊乱相关症状，如肿瘤压迫周围神经组织，会导致相应区域出现感觉异常、运动障碍等神经紊乱症状。
三、环境因素作用
长期不良生活环境： 长期处于嘈杂、污染严重的环境中也可能引发神经紊乱。比如长期生活在噪音超过80分贝的环境中，持续1年以上，就会对神经系统产生不良影响，出现耳鸣、烦躁、睡眠障碍等神经紊乱症状。还有长期处于空气污染严重的环境中，空气中的有害物质会影响神经细胞的正常代谢，增加神经紊乱的发生风险。重大生活事件刺激： 经历重大生活事件刺激也容易导致神经紊乱。像亲人突然离世、遭遇严重的交通事故、失业等重大生活事件，在事件发生后的1~2个月内，很多人会出现情绪波动大、失眠、食欲不振等神经紊乱表现。而且这类重大生活事件的刺激强度越大，引发神经紊乱的可能性就越高，持续时间也可能更长。