指甲长到肉里化脓即甲沟炎，需依据化脓严重程度来选择处理方式：
一、若化脓范围较小或处于较表层，可采取热敷、理疗、外敷鱼石脂软膏或金黄散等办法来缓解。热敷能够促进局部血液循环，帮助炎症消退；理疗可采用特定的物理因子，如红外线等进行治疗；鱼石脂软膏具有温和刺激性和消炎、防腐及消肿作用；金黄散能清热解毒、消肿止痛。
二、若炎症较为严重，则需手术治疗。当单侧甲沟已有脓液时，可在甲沟处作纵行切开引流，以清除脓液；若感染已波及指甲基部皮下周围时，可在两侧甲沟各作纵行切口，将甲根上皮片翻起，切除指甲根部，置入一小片凡士林纱布或乳胶片引流。
三、要是甲沟炎严重到甲床下积脓，应将指甲拔去，或者把脓腔上的指甲剪去。拔甲时要注意避免损伤甲床，以防新生指甲出现畸形。然而拔甲后，由于较长时间没有指甲的保护，伤口会比较疼痛且容易受伤，所以在此期间应减少活动、走动，充分休息，伤口不可沾水，保持卫生，并按时换药。
总之，对于甲沟炎化脓的处理要根据具体情况选择合适方法，同时要注意后续的护理，以促进伤口恢复和避免复发。