宝宝出生后阴茎小的原因主要有以下几种：
一、还未发育
男孩的阴茎发育相对较为缓慢。随着年龄的增长，男孩的阴茎和包皮会持续发生变化，阴茎的发育会逐渐超越包皮，从包皮中逐渐显露出来。针对这种情况，无需进行特殊治疗，但平时要注意宝宝阴茎的卫生，避免给宝宝穿紧身的内裤。
二、肥胖
如果宝宝较为肥胖，脂肪堆积较多，阴茎在脂肪皮层的遮盖下就会显得短小。这种情况通常随着年龄增长以及体重减轻，可自行逐渐好转。
三、阴茎肉膜发育不良
由于肉膜直接附着于阴茎体的前端且发育异常，形成了纤维索带从而限制了阴茎的外露。对于这种情况，需要在医师的指导下选择采用药物或手术进行治疗。
总之，宝宝出生后阴茎小可能是多种原因导致的，要根据具体情况进行判断和处理。如果对宝宝阴茎的情况存在疑虑，应及时咨询专业医生。