上颚牙肉肿通常是由多种原因引起的，比如常见的牙龈炎，这是由于口腔卫生不良，牙菌斑、牙结石堆积刺激牙龈导致的，约有70% - 80%的成年人患有不同程度的牙龈炎。
一、牙周炎导致
菌斑堆积： 牙周炎主要是因为牙面上的菌斑没有及时清除，菌斑中的细菌产生毒素等有害物质，长期刺激牙周组织，就会引发上颚牙肉肿。菌斑是一种不断在牙齿表面形成的柔软、无色的细菌膜。牙龈红肿出血： 牙周炎患者除了上颚牙肉肿，还会出现牙龈红肿、容易出血的情况，严重时还可能导致牙齿松动。
二、智齿冠周炎引发
智齿萌出异常： 智齿萌出空间不足时，牙冠周围的牙龈组织就会发炎肿胀，导致上颚相应部位的牙肉肿。这种情况在18 - 25岁的青年人群中比较常见。疼痛影响进食： 智齿冠周炎发作时，患者会感到局部疼痛明显，甚至影响张口和进食，吞咽时疼痛可能会加重。
三、局部创伤所致
咬伤或刺伤： 不小心咬伤上颚或者被硬物刺伤上颚牙龈，都可能引起牙肉肿。比如吃东西时说话导致牙齿咬伤自己的上颚牙龈。创伤处感染： 受伤后的牙龈如果没有得到良好的护理，很容易发生感染，从而出现肿胀的情况，一般创伤后1 - 2天可能就会开始出现肿胀迹象。
四、全身性疾病反映
血液系统疾病： 像白血病等血液系统疾病，可能会导致牙龈增生、肿胀，包括上颚牙肉肿。这类疾病往往还会伴有其他症状，比如发热、贫血等。糖尿病： 糖尿病患者由于血糖控制不佳，口腔局部抵抗力下降，容易发生感染，也可能出现上颚牙肉肿的情况，并且伤口不容易愈合。