牙肉疼可能由多种原因引起，常见的比如牙龈炎，这是由于牙菌斑、牙结石长期刺激牙龈导致的，据统计，成年人中约70%~90%有不同程度的牙龈炎。
牙龈炎导致的牙肉疼
牙菌斑堆积： 牙菌斑是一种柔软、无色的细菌薄膜，会不断在牙齿表面形成，如果不及时清除，就会刺激牙龈，引发炎症，出现牙肉疼的情况。牙结石刺激： 牙菌斑钙化后形成牙结石，牙结石会持续刺激牙龈，加重炎症反应，导致牙肉持续疼痛，而且牙结石一旦形成，靠刷牙很难去除。
牙周炎引发的牙肉疼
牙周组织感染： 牙周炎是牙周组织的慢性感染性疾病，细菌侵犯牙周组织后，会引起牙龈红肿、出血，进而导致牙肉疼痛，病情严重时还可能出现牙周袋形成、牙齿松动等问题。牙槽骨吸收： 随着牙周炎的发展，牙槽骨会逐渐吸收，这会使牙齿的支持组织遭到破坏，进一步加重牙肉疼的症状，而且牙槽骨一旦吸收，很难恢复到原来的状态。
智齿冠周炎造成的牙肉疼
智齿萌出受阻： 智齿是口腔中最后萌出的牙齿，很多人智齿萌出空间不足，导致智齿部分萌出或完全不能萌出，牙冠周围的牙龈组织就会发炎肿痛，尤其是在进食、说话时疼痛会加重。细菌感染： 智齿周围的牙龈瓣与牙齿之间形成较深的盲袋，食物残渣容易嵌塞在盲袋内，细菌大量繁殖后引发感染，造成牙肉剧烈疼痛，这种疼痛可能会放射到面部其他部位。