甲胎蛋白（AFP）偏高主要有以下一些常见原因。一般来说，成人血清AFP正常值通常小于25μg/L，当AFP明显升高时需引起重视。
一、生理性因素
妊娠期间：女性在妊娠3个月后，AFP会开始升高，到妊娠7 - 8个月时可达最高峰，一般会在400μg/L以下，分娩后约3周恢复正常。这是因为胎儿的肝细胞会合成AFP，然后进入母体血液循环。新生儿时期：新生儿的AFP也会偏高，出生后1周可降至25μg/L，约在1岁时接近成人水平。
二、肝脏疾病相关
急慢性肝炎：在肝炎活动期，肝细胞受到损伤，会有部分肝细胞再生，此时AFP会轻度升高，一般会在400μg/L以下，随着肝炎病情的好转，AFP会逐渐恢复正常。例如，急性肝炎患者经过积极治疗，肝功能逐渐恢复，AFP也会随之下降。肝硬化：肝硬化患者的肝细胞再生过程中，也可能会出现AFP轻度升高的情况，通常AFP一般不超过400μg/L，不过需要定期监测AFP的变化，因为少数肝硬化患者可能会并发肝癌，此时AFP会明显升高。
三、肿瘤相关因素
原发性肝癌：这是导致AFP明显升高的重要原因之一。在原发性肝癌患者中，约70% - 90%的患者AFP会明显升高，而且AFP的水平往往与肝癌的大小有一定关系，肝癌体积越大，AFP浓度越高。另外，生殖细胞肿瘤如睾丸癌、卵巢癌等也可能会引起AFP偏高，不过相对原发性肝癌来说比例较低。