刚怀孕小肚子疼的原因包括正常生理现象、妇科炎症、先兆流产以及宫外孕等。
一、正常生理现象：怀孕后子宫和盆腔会受到一定刺激，容易处于充血状态，这就会使女性出现小腹隐痛症状。不过，这种症状通常会在一段时间后自行消失，一般无需进行特殊处理。
二、妇科炎症：本身患有盆腔炎症的女性在怀孕后，炎症依然会对盆腔等部位产生刺激，此时便容易出现小腹疼痛的情况。针对这种状况，患者可在医生指导下通过如甲硝唑以及阿奇霉素等抗生素来进行治疗，这是为了防止孕妇因盆腔炎而导致流产。
三、先兆流产：孕激素水平较低的女性可能会出现先兆流产现象，除了小腹疼痛的表现外，还会伴有阴道出血。此时必须及时进行保胎治疗。
四、宫外孕：怀孕初期的女性若出现小腹持续性疼痛且伴有不规则阴道出血，有可能是宫外孕所导致。此时应尽快通过B超等检查来确诊，并及时予以治疗，以免对患者身体造成严重危害。
总之，刚怀孕时小肚子疼可能是多种情况引起的，需要仔细甄别并根据具体情况进行相应的处理和治疗。