新生儿黄疸是新生儿时期常见的现象，约60%足月儿和80%早产儿在出生后会出现黄疸。这主要与新生儿自身的生理特点有关。
胆红素生成过多
红细胞数量多且寿命短： 新生儿出生时红细胞数量比成人多，且红细胞寿命相对较短，一般为70~90天，而成人红细胞寿命约120天，所以红细胞破坏快，产生胆红素多。血红素加氧酶含量高： 新生儿体内血红素加氧酶含量高，这种酶能促使血红素分解为胆红素，进一步使得胆红素生成增加。
肝脏处理胆红素能力不足
肝细胞摄取胆红素能力弱： 新生儿出生后，肝细胞内Y、Z蛋白含量低，这两种蛋白是摄取胆红素的重要载体，所以摄取胆红素的能力较弱。一般要到出生后5~10天才逐渐增加。肝细胞结合胆红素能力差： 肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UDPGT）活性不足，该酶是将未结合胆红素转化为结合胆红素的关键酶，活性不足导致结合胆红素的能力差，使得未结合胆红素在体内积聚。
肠肝循环特点
肠道菌群尚未完全建立： 新生儿肠道内正常菌群尚未完全建立，肠道内的β - 葡萄糖醛酸苷酶活性较高，这种酶能将结合胆红素水解成未结合胆红素，使得未结合胆红素又被肠道重新吸收进入血液，形成肠肝循环，导致血中胆红素水平升高。一般要等肠道菌群建立完善后，这种情况才会改善。