耳后根内部长疙瘩一按就疼，可能是由以下原因引起：
1.淋巴结炎：耳后淋巴结丰富，当发生感染时，可导致淋巴结肿大、疼痛。常见的原因包括上呼吸道感染、耳部感染等。
2.皮脂腺囊肿：这是一种常见的皮肤良性肿瘤，由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。囊肿发生感染时，可出现红肿、疼痛。
3.疖肿：是毛囊深部及周围组织的化脓性炎症，好发于头、面、颈、臀等部位，也可发生于外耳道。初起为毛囊性炎症丘疹，基底浸润明显，随后炎症向周围扩展，形成质硬结节，伴红肿热痛。
4.其他：如脂肪瘤、纤维瘤、表皮样囊肿等，也可能出现类似症状。
此外，恶性肿瘤如淋巴瘤、转移癌等也需排除。
如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，进行详细的检查，如血常规、超声等，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持耳部清洁，避免搔抓和挤压疙瘩，以免加重症状。