怀孕36周时小腹底端疼可能由以下原因引起：
1.生理原因：
子宫增大：怀孕36周时，子宫已经很大，可能会压迫腹部和骨盆的神经和血管，导致小腹底端疼痛。
假性宫缩：假性宫缩是孕期常见的现象，可能会导致小腹底端疼痛，通常没有规律，且持续时间较短。
2.病理原因：
早产：如果疼痛伴有阴道出血、破水等症状，可能是早产的迹象，需要及时就医。
胎盘早剥：胎盘早剥是一种严重的并发症，可能会导致小腹底端疼痛、阴道出血等症状，需要立即就医。
其他：其他可能导致小腹底端疼的病理原因包括泌尿系统感染、疝气等。
如果怀孕36周时出现小腹底端疼，建议采取以下措施：
1.休息：尽量休息，避免过度劳累和长时间站立。
2.改变姿势：改变姿势，如躺下或坐下，可能会缓解疼痛。
3.热敷：用热水袋或热毛巾轻轻敷在小腹底端，可能会缓解疼痛。
4.就医：如果疼痛持续不缓解、伴有其他症状或加重，应及时就医，进行详细的产前检查，以确保孕妇和胎儿的健康。
需要注意的是，每个孕妇的情况都不同，如果对疼痛的原因或处理有任何疑问，应咨询医生的意见。医生会根据具体情况进行评估，并提供个性化的建议和治疗方案。同时，孕妇应密切关注胎儿的胎动和宫缩情况，如有异常应及时告知医生。