室间隔缺损膜部缺损有一定自愈可能，一般小型室间隔缺损膜部缺损在1岁内有自愈的情况，据统计约有20% - 50%的小型膜部室间隔缺损可在5岁前自然闭合。
缺损大小与自愈的关系
小型缺损： 缺损直径小于5毫米的膜部室间隔缺损，自愈的可能性相对较大。这类缺损对心脏血流动力学影响较小，随着孩子生长发育，心脏组织有自行修复闭合的机会。比如一些新生儿或小婴儿发现的小型膜部室间隔缺损，很多在1 - 2岁内就可能闭合。中型缺损： 缺损直径在5 - 10毫米之间的膜部室间隔缺损，自愈的概率相对小型缺损会低一些，但仍有一定可能。一般观察到3岁左右，如果还未闭合，自行闭合的机会就相对减少了。大型缺损： 缺损直径大于10毫米的膜部室间隔缺损，自愈的可能性较小。这类缺损对心脏的影响较大，往往需要通过医疗干预来解决，如手术等。
年龄因素对自愈的影响
婴儿期： 婴儿时期，心脏的生长发育较快，对于膜部室间隔缺损有一定的自我修复潜力。在婴儿6个月内发现的膜部室间隔缺损，要密切观察，很多有自愈的可能。但如果到了婴儿8 - 12个月还未闭合，后续自愈的几率就会降低。幼儿期： 1 - 3岁的幼儿，心脏的结构和功能逐渐趋于稳定，这时候膜部室间隔缺损自愈的机会相对婴儿期有所下降。如果到3岁仍未闭合，可能需要考虑进一步的治疗措施。
伴随症状与自愈的关联
无症状情况： 如果孩子发现膜部室间隔缺损时没有明显的症状，如呼吸急促、口唇发绀、生长发育迟缓等，那么自愈的可能性相对较高。因为没有症状说明心脏功能还没有受到明显影响，心脏有较好的条件去尝试修复缺损。有症状情况： 当孩子出现明显的症状，如活动后气促、容易疲劳、生长发育落后等，说明缺损对心脏功能已经产生了一定影响，这时候自愈的可能性就会降低，往往需要及时就医评估，考虑是否需要手术等治疗手段来解决缺损问题。