滴虫性龟头炎主要通过硝基咪唑类药物治疗，其中甲硝唑是常用药物之一。一般来说，患者遵医嘱规范用药，多数能取得较好疗效。
药物治疗选择
甲硝唑： 属于硝基咪唑类药物，能够抑制滴虫的氧化还原反应，使原虫氮链发生断裂，从而发挥杀灭滴虫的作用。通常可口服甲硝唑片进行治疗。替硝唑： 也是硝基咪唑类药物，其抗菌谱与甲硝唑相似，对滴虫也有较好的抑制和杀灭效果，可口服或局部外用。
局部治疗方法
清洗患处： 患者可以用0.5%醋酸溶液或1:5000高锰酸钾溶液清洗龟头和包皮部位，每天1 - 2次，这样能保持局部清洁，减少滴虫的滋生环境。局部涂药： 可以在清洗后，局部涂抹甲硝唑凝胶等药物，帮助直接作用于患处，抑制滴虫生长。
生活注意事项
避免性生活： 在治疗期间，患者应避免性生活，因为滴虫性龟头炎具有传染性，性生活可能会将滴虫传染给性伴侣，同时也可能导致自身病情加重。保持个人卫生： 要勤换内裤，内裤最好选择棉质宽松的，换洗的内裤要单独清洗，避免与其他衣物混洗，防止交叉感染。伴侣同治： 滴虫性龟头炎往往是夫妻双方相互感染，所以性伴侣也需要同时进行检查和治疗，否则即使一方治愈，也可能通过性生活再次感染对方。
特殊人群情况
儿童患者： 儿童患滴虫性龟头炎相对较少见，若发生，用药需谨慎，应在医生指导下选择合适的药物及治疗方式，严格遵循医生的用药建议，避免自行用药导致不良后果。孕妇患者： 孕妇患有滴虫性龟头炎时，用药更要慎重，需在医生充分评估利弊后选择对胎儿影响较小的治疗方法，不能自行盲目用药，以免影响胎儿发育。