经常口腔溃疡的原因有多种。一般来说，约20% - 30%的人属于复发性阿弗他溃疡，其发生可能与遗传因素有关，如果父母经常长口腔溃疡，子女患病几率会相对较高。
局部创伤因素
口腔内刺激： 牙齿的残冠、残根或者不合适的假牙等，会持续摩擦口腔黏膜，从而引发口腔溃疡。比如有的患者牙齿有锐利的边缘，长期刺激口腔内侧黏膜，就容易反复长溃疡。咬伤口腔： 吃饭时不小心咬到口腔黏膜，也可能形成创伤性口腔溃疡，这种情况在吃饭速度快或者注意力不集中时较易发生。
免疫系统问题
免疫力下降： 当人体免疫力降低时，比如过度疲劳、睡眠严重不足、患有慢性疾病等情况下，就容易受到病菌侵袭，进而引发口腔溃疡。像一些长期熬夜的人，身体免疫力下降，口腔溃疡就容易找上门。自身免疫反应异常： 有些自身免疫性疾病也会导致口腔溃疡反复发作，例如白塞病，除了口腔溃疡外，还可能伴有眼部病变、生殖器溃疡等症状。
营养缺乏
维生素缺乏： 缺乏维生素B族（如B1、B2、B6、B12等）以及维生素C时，容易出现口腔溃疡。比如长期挑食、节食的人，很可能因为营养摄入不均衡而缺乏这些维生素，从而引发口腔溃疡。微量元素缺乏： 缺锌、缺铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡的发生有关。锌参与人体多种代谢过程，缺铁会影响血红蛋白的合成，进而影响身体的正常功能，增加口腔溃疡的发生风险。
精神心理因素
压力过大： 长期处于高压力状态下，如工作压力大、学习负担重等，会导致人体内分泌失调，影响免疫系统功能，从而诱发口腔溃疡。例如学生在考试期间，由于精神高度紧张，口腔溃疡的发生率可能会增加。情绪波动： 焦虑、抑郁、紧张等不良情绪也可能引发口腔溃疡。当人的情绪处于不稳定状态时，会通过神经内分泌系统影响口腔黏膜的正常代谢，导致口腔溃疡反复发作。