长期服用短效避孕药可能存在一些潜在危害。一般来说，短效避孕药正确使用时相对安全，但长期服用可能有以下情况：
对代谢的影响
体重方面：部分女性长期服用短效避孕药后可能出现体重变化，有研究显示约有5% - 10%的女性可能会出现体重轻度增加，这可能与药物导致水钠潴留以及影响代谢有关。血脂影响：少数人长期服用短效避孕药可能会使血脂有一定波动，比如可能导致低密度脂蛋白轻度升高，不过这种情况在停药后大多可逐渐恢复。
对月经的影响
月经周期改变：有些女性长期服用短效避孕药后，月经周期可能会变得不那么规律，比如原本28天左右的周期可能会延长或缩短1 - 2天，不过大多属于轻微变化。月经量变化：可能出现月经量减少的情况，一般减少幅度在原来的1/3以内，但也有少数人会出现月经量增多的现象，不过相对较少见。
对心血管系统的影响
血压影响：长期服用短效避孕药可能会对血压有一定影响，尤其是本身有高血压家族史或存在血压偏高倾向的女性，可能会使血压轻度升高，但这种情况发生的概率相对较低，大约在1% - 3%左右。血栓风险：虽然总体概率较低，但长期服用短效避孕药确实会增加静脉血栓形成的风险，不过一般低于1/1000，而且随着年龄增长、吸烟等因素会使风险有所升高。
对其他方面的影响
情绪影响：个别女性长期服用短效避孕药后可能会出现情绪波动，比如出现抑郁倾向等，但这种情况比较少见，发生率低于5%。对未来生育的影响：一般来说，长期服用短效避孕药停药后，生育能力会很快恢复，对未来怀孕和分娩通常没有长期不良影响，但仍建议在停药后尝试怀孕前咨询医生。不过也有极个别情况，长期用药可能会在短期内对生殖内分泌有一定调整期，但大多不影响后续正常生育。