透明隔囊肿一般不会自行消失。透明隔囊肿是一种先天性的脑部结构异常，多数情况下囊肿会持续存在。
透明隔囊肿的形成机制
透明隔囊肿是由于胚胎发育过程中透明隔间腔没有闭合，逐渐形成了囊肿样结构。它通常是在脑部发育过程中就已经存在的情况，一旦形成，自身很难发生消失的变化。
无症状的透明隔囊肿情况
如果透明隔囊肿较小且患者没有任何症状，这种情况下一般不需要特殊治疗，但需要定期进行脑部影像学检查，比如每隔6 - 12个月做一次头颅磁共振成像（MRI），观察囊肿是否有变化。因为部分患者的囊肿可能会长期保持稳定状态，不出现明显的症状变化。
有症状的透明隔囊肿情况
当透明隔囊肿较大，压迫周围脑组织，导致患者出现头痛、癫痫发作、认知功能障碍等症状时，通常需要进行干预。但干预方式一般不是等待囊肿消失，而是根据具体病情采取手术等治疗措施来缓解症状，比如囊肿 - 腹腔分流术等手术方式，通过手术来改变囊肿对脑组织的压迫状况，而不是让囊肿自行消失。
透明隔囊肿的监测要点
对于发现有透明隔囊肿的人群，无论是儿童还是成人，都要关注自身是否出现头痛、头晕、视力改变等异常表现。如果出现这些症状，应及时就医进行进一步的评估和处理。同时，在监测过程中要遵循医生制定的检查间隔时间，以便及时发现囊肿的变化情况，从而采取合适的应对措施。