烟雾病的病因目前尚未完全明确，但有一些相关因素被研究发现。目前认为约10%的烟雾病患者有明确的家族遗传倾向，研究显示某些特定基因的突变可能与烟雾病的发生有关。
遗传因素相关
家族遗传特点： 烟雾病存在一定的家族聚集现象，有研究表明在烟雾病患者的一级亲属中，烟雾病的患病率比普通人群高出一定比例。如果家族中有亲属患有烟雾病，那么其他成员患烟雾病的风险相对增加。基因关联情况： 目前已经发现一些基因与烟雾病的发病相关，例如RNF213基因的突变与烟雾病的相关性较为密切。携带特定突变形式RNF213基因的个体，发生烟雾病的概率会明显高于不携带该突变基因的人群。
先天性因素影响
胚胎发育阶段： 在胚胎发育的过程中，如果出现一些异常情况，可能会导致脑血管发育异常，进而引发烟雾病。在胚胎早期血管形成和发育的关键时期，某些因素干扰了血管的正常分化和生长，就可能使得脑血管出现像烟雾病那样的异常改变。血管结构异常： 烟雾病患者的脑血管存在明显的结构异常，主要表现为颈内动脉末端及其大分支进行性狭窄或闭塞，同时颅底会出现异常的烟雾状血管网。这种先天性的血管结构发育异常是烟雾病发病的重要内在因素之一。
其他可能相关因素
感染因素推测： 有研究推测某些感染因素可能与烟雾病的发生存在关联。例如，有学者发现部分烟雾病患者在发病前有过感染的经历，不过目前这方面的证据还不是非常确凿，还需要更多的研究来明确感染与烟雾病发病的确切关系。免疫因素涉及： 免疫因素也被认为可能参与了烟雾病的发病过程。机体的免疫系统异常可能会对脑血管产生攻击，导致脑血管出现炎症反应等改变，进而影响脑血管的正常结构和功能，最终引发烟雾病，但具体的免疫作用机制还有待进一步深入研究。